Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn11Q60771 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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