Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Csnk2a1Q60737 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms