Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a3Q5XF89 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms