Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf1Q5U4C3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Scaf1Q5U4C3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf1Q5U4C3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms