Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabl6Q5U3K5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabl6Q5U3K5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms