Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TefmQ5SSK3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TefmQ5SSK3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms