Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zzef1Q5SSH7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zzef1Q5SSH7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zzef1Q5SSH7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms