Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bod1Q5SQY2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms