Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trav3-3Q5R1C3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms