Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Trim41Q5NCC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Trim41Q5NCC3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Trim41Q5NCC3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Trim41Q5NCC3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms