Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps41Q5KU39 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps41Q5KU39 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms