Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrc3Q5DU56 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nlrc3Q5DU56 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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