Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms