Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp13Q5BKP2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp13Q5BKP2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp13Q5BKP2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms