Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Eme2Q56A04 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Eme2Q56A04 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms