Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ulk4Q3V129 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ulk4Q3V129 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ulk4Q3V129 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ulk4Q3V129 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ulk4Q3V129 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ulk4Q3V129 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ulk4Q3V129 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ulk4Q3V129 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ulk4Q3V129 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ulk4Q3V129 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ulk4Q3V129 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ulk4Q3V129 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms