Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc185Q3V118 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms