Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tbc1d9Q3UYK3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tbc1d9Q3UYK3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tbc1d9Q3UYK3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms