Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc160Q3UYG1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc160Q3UYG1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms