Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhdc9Q3USL1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klhdc9Q3USL1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms