Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28047Q3US59 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm28047Q3US59 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28047Q3US59 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms