Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Znf48Q3US17 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Znf48Q3US17 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Znf48Q3US17 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Znf48Q3US17 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Znf48Q3US17 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Znf48Q3US17 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Znf48Q3US17 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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Znf48Q3US17 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Znf48Q3US17 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Znf48Q3US17 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf48Q3US17 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Znf48Q3US17 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Znf48Q3US17 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Znf48Q3US17 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf48Q3US17 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf48Q3US17 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf48Q3US17 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf48Q3US17 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf48Q3US17 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Znf48Q3US17 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf48Q3US17 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf48Q3US17 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf48Q3US17 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf48Q3US17 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf48Q3US17 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Znf48Q3US17 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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