Protein–RNA interactions for Protein: Q3URQ4

Fam8a1, Family with sequence similarity 8, member A1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam8a1Q3URQ4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam8a1Q3URQ4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam8a1Q3URQ4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam8a1Q3URQ4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms