Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Washc4Q3UMB9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Washc4Q3UMB9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms