Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sf3b2Q3UJB0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sf3b2Q3UJB0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms