Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef1Q3UHC1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgef1Q3UHC1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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