Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH06

Rreb1, Ras-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rreb1Q3UH06 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rreb1Q3UH06 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rreb1Q3UH06 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rreb1Q3UH06 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rreb1Q3UH06 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms