Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arfgef3Q3UGY8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arfgef3Q3UGY8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arfgef3Q3UGY8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Arfgef3Q3UGY8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Arfgef3Q3UGY8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Arfgef3Q3UGY8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Arfgef3Q3UGY8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arfgef3Q3UGY8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms