Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3j1Q3UGC7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3j1Q3UGC7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3j1Q3UGC7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3j1Q3UGC7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3j1Q3UGC7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3j1Q3UGC7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3j1Q3UGC7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3j1Q3UGC7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms