Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nom1Q3UFM5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nom1Q3UFM5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms