Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp8Q3UD82 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Parp8Q3UD82 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms