Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3U6N9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q3U6N9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q3U6N9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q3U6N9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q3U6N9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U6N9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q3U6N9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q3U6N9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q3U6N9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q3U6N9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q3U6N9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q3U6N9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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