Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U595 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U595 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U595 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U595 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U595 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U595 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U595 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U595 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U595 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U595 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U595 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U595 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U595 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U595 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U595 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U595 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U595 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U595 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U595 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U595 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U595 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U595 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U595 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U595 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U595 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U595 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U595 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U595 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U595 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U595 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U595 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U595 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U595 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U595 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U595 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U595 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U595 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U595 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q3U595 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U595 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U595 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U595 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U595 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U595 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U595 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U595 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U595 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U595 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U595 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U595 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U595 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U595 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U595 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U595 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U595 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U595 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U595 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U595 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U595 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U595 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U595 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U595 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U595 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U595 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U595 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms