Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Vars2Q3U2A8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vars2Q3U2A8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vars2Q3U2A8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms