Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pag1Q3U1F9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pag1Q3U1F9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms