Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a5Q3TYU2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms