Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calr4Q3TQS0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Calr4Q3TQS0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms