Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp39Q3TIX9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms