Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN8

Defb25, Beta-defensin 25, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb25Q30KN8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Defb25Q30KN8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Defb25Q30KN8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defb25Q30KN8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms