Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b3Q0VF55 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b3Q0VF55 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b3Q0VF55 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms