Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem52bQ0VBF2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms