Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Lrriq1Q0P5X1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lrriq1Q0P5X1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Lrriq1Q0P5X1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Lrriq1Q0P5X1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms