Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Calb2Q08331 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb2Q08331 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms