Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a2Q07643 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col9a2Q07643 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms