Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfe2Q07279 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms