Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd1Q04519 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms