Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl7Q03366 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl7Q03366 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl7Q03366 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl7Q03366 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl7Q03366 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl7Q03366 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl7Q03366 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl7Q03366 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl7Q03366 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl7Q03366 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 305.4 ms