Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd1Q02242 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd1Q02242 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms