Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelpQ01102 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SelpQ01102 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SelpQ01102 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SelpQ01102 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SelpQ01102 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SelpQ01102 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelpQ01102 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelpQ01102 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelpQ01102 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelpQ01102 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelpQ01102 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelpQ01102 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SelpQ01102 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelpQ01102 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SelpQ01102 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SelpQ01102 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SelpQ01102 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms