Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf2raQ00941 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2raQ00941 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms